面對(duì)重癥感染患者，能否快速確認(rèn)感染性疾病原體，成為后續(xù)對(duì)癥治療的關(guān)鍵。傳統(tǒng)的微生物鑒定方法分為培養(yǎng)和非培養(yǎng)兩類(lèi)，臨床公認(rèn)的“金標(biāo)準(zhǔn)”是分離培養(yǎng)和生化鑒定，這種方法的操作周期長(zhǎng)、失敗率高，并且不是每種病原體都可以培養(yǎng)。不依賴(lài)培養(yǎng)的方法比如涂片鏡檢、抗體抗原免疫等，在采樣當(dāng)天即可報(bào)告結(jié)果。這些方法的時(shí)效性強(qiáng)，但在敏感性和特異性上存在較明顯的劣勢(shì)，而且傳統(tǒng)的微生物鑒定方法對(duì)于未知或者罕見(jiàn)的病原微生物，無(wú)法快速識(shí)別。

而mNGS不依賴(lài)于傳統(tǒng)的微生物培養(yǎng)，也無(wú)需特異性擴(kuò)增，直接對(duì)臨床樣本中的核酸進(jìn)行無(wú)差別、無(wú)選擇性的高通量測(cè)序，然后與已知的微生物序列數(shù)據(jù)庫(kù)進(jìn)行比對(duì)分析，根據(jù)比對(duì)到的序列信息來(lái)判斷樣本包含的病原微生物種類(lèi)，能夠快速、客觀地檢測(cè)臨床樣本中的病原微生物（包括病毒、細(xì)菌、真菌、寄生蟲(chóng)）

目前已經(jīng)有數(shù)十篇mNGS專(zhuān)家共識(shí)中提到，對(duì)于一些危重癥感染患者，建議留取合適的標(biāo)本，進(jìn)行mNGS檢測(cè)，更快更精準(zhǔn)的幫助臨床找到感染性疾病原體，從而精準(zhǔn)使用抗生素。

拿到一份mNGS報(bào)告應(yīng)該關(guān)注以下專(zhuān)業(yè)名詞：

l讀長(zhǎng)：測(cè)序儀單個(gè)測(cè)序反應(yīng)所得到的堿基序列。讀長(zhǎng)長(zhǎng)度指該堿基序列的堿基數(shù)。讀長(zhǎng)數(shù)量指測(cè)序獲得的堿基序列的數(shù)量。

l相對(duì)豐度：指除去宿主序列之后，某微生物物種序列在相應(yīng)大類(lèi)物種（通常分成細(xì)菌、真菌、病毒、寄生蟲(chóng)4大類(lèi)）中的分布比例。豐度越高，表示該物種所占比例越高。

l檢出限（limit of detection，LOD）：指檢測(cè)對(duì)象可以被某特定方法可靠地檢測(cè)到的最低濃度（嚴(yán)格意義上是達(dá)到某概率的最低檢測(cè)濃度）。

l比對(duì)：指將測(cè)序的讀長(zhǎng)與參考基因組進(jìn)行匹配的過(guò)程。

l檢出序列數(shù)（reads）：配到該病原體的序列數(shù)目，其多少與標(biāo)本中病原體本身載量負(fù)荷、核酸提取量、人源序列比例有關(guān)。序列數(shù)越高，表示標(biāo)本中檢測(cè)到該病原體的可信度越高。

llmNGS報(bào)告具體如何解讀建議進(jìn)一步詢(xún)問(wèn)臨床醫(yī)生。